超聲波提取設備可以不斷被介質的質點吸收，介質將所吸收能量的全部或大部分轉變成熱能，從而導致介質本身和藥材組織溫度的升高，增大了藥物有效成分的溶解度，加快了有效成分的溶解速度。由于這種吸收聲能引起的藥物組織內部溫度的升高是瞬時的，因此可以使被提取的成分的結構和生物活性保持不變。導致媒質質點溫度升高，即超聲波熱學機制。
超聲波提取設備同時當大能量的超聲波作用于提取介質，在振動處于稀疏狀態時，介質被撕裂成許多小空穴，這些小空穴瞬時即閉合，閉合時產生高達幾千大氣壓的瞬時壓力，即空化現象。
空化中產生的極大壓力造成被破碎物細胞壁及整個生物體破裂，而且整個破裂過程在瞬間完成，同時超聲波產生的振動作用加強了胞內物質的釋放、擴散及溶解。超聲波提取設備工作過程是一個物理過程，浸提過程中無化學反應，被浸提的生物活性物質在短時間內保持不變，摸索出了超聲提取的工藝及超聲提取規律性，同時也探索了所得到的化學成分結構的變化。因此在檢測前必須制備精密樣品液，以滿足檢測的需要，樣品液的制備必須通過提取。常規提取法提取時間長、繁瑣，超聲提取法用時短、方法簡單、操作方便。當用于中藥材粉碎時，既可以使粒度很小，又可以使藥物分子離子化而帶電；便于機體吸收，提高藥物療效。
